| 2026年1月28日 | 特別展「子どもミュージアム 夜のいきもの展」 |
| 2025年6月14日 | 令和7年度 自然部門 常設展示
・水戸の地形の特徴と生き物 ・変わりゆく水戸の生き物 |
| 2024年9月1日 | 令和6年度 自然部門 常設展示
テーマ1 水戸の地形の特徴と生き物 テーマ2 変わりゆく水戸の生き物 |
| 2024年8月25日 | 夏休み子どもミュージアム そらとぶいきもの大集合!(終了) |
| 2023年6月29日 | 子どもミュージアム 昆虫の不思議 |
| 2022年6月10日 | 令和4年度 自然部門 常設展示 |
| 2022年1月7日 | 渡り鳥の不思議ー行く鳥 来る鳥ー |
| 2021年6月11日 | 令和3年度 自然部門常設展示 |
| 2020年8月19日 | ざんねんな 鳥&茨城のいきもの展 |
| 2020年6月12日 | 令和2年度 自然部門 常設展示 |
| 2019年12月13日 | 水戸の大地の成り立ちー水戸140億年史ー |
| 2019年6月16日 | 令和元年度 自然部門 常設展示 |